2011 年的 Swartz Prize for Theoretical and Computational Neuroscience 由 Haim Sompolinsky 得到。
請見:
http://www.theswartzfoundation.org/news_show.asp?newsID=76
Haim Sompolinsky 的研究室網站:
http://neurophysics.huji.ac.il/~haim/
Swartz Foundation 是個研究神經和腦理論的單位,特別著重計算神經科學。過去三年得 Swartz Prize 的名單分別是
2010: Larry Abbott
2009: Horace Barlow
2008: Wilfrid Rall
有興趣的朋友,可以查查看這幾位專家的研究著作,了解計算神經科學可以玩到什麼程度。
Have fun.
這個網站的目的,是要分享如何用電腦幫助學習生物學。透過用電腦模擬計算,來幫助我們瞭解某些生理現象和生化友應。此外,也歡迎討論生物資訊在醫學上的應用。
歡迎各位朋友蒞臨指教。
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Nov 15, 2011
Oct 19, 2011
Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology
Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology
酵素 E.C. number 的資料庫
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/index.html
搜尋介面
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/search.html
例如打入 2.7.1.1,就會得到
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/1/1.html
並可以連結到其它資料庫。
酵素 E.C. number 的資料庫
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/index.html
搜尋介面
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/search.html
例如打入 2.7.1.1,就會得到
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/1/1.html
並可以連結到其它資料庫。
MathMol 分子模擬入門教學網頁
MathMol 是一個分子模擬的入門網站,有給高中生或入門都的教材。
http://www.nyu.edu/pages/mathmol/software.html
它推薦的常用軟體
http://www.nyu.edu/pages/mathmol/software.html
http://www.nyu.edu/pages/mathmol/software.html
它推薦的常用軟體
http://www.nyu.edu/pages/mathmol/software.html
Jun 16, 2011
用 "Crystal Structure Databases" 學習化學分子的性質
在 Journal of Chemical Education 期刊中,有幾篇談如何用 Crystal Structure Databases 來學化學的文章。
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 1. An Interactive Web-Accessible Teaching Subset of the Cambridge Structural Database
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 2. Teaching Units That Utilize an Interactive Web-Accessible Subset of the Cambridge Structural Database
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 3. The Cambridge Structural Database System: Information Content and Access Software in Educational Applications
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 4. Examples of Discovery-Based Learning Using the Complete Cambridge Structural Database
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 1. An Interactive Web-Accessible Teaching Subset of the Cambridge Structural Database
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 2. Teaching Units That Utilize an Interactive Web-Accessible Subset of the Cambridge Structural Database
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 3. The Cambridge Structural Database System: Information Content and Access Software in Educational Applications
Teaching Three-Dimensional Structural Chemistry Using Crystal Structure Databases. 4. Examples of Discovery-Based Learning Using the Complete Cambridge Structural Database
[book] Kinetic modelling in systems biology
這是一本談系統生物學中動力學模擬的入門書,作者是俄國人。
Kinetic Modelling in Systems Biology
Oleg Demin, Igor Goryanin
http://www.amazon.com/Kinetic-Modelling-Systems-Mathematical-Computational/dp/1584886676
書中用的軟體是作者研發的 DBSolve。有興趣的朋友,可以玩玩看。
Kinetic Modelling in Systems Biology
Oleg Demin, Igor Goryanin
http://www.amazon.com/Kinetic-Modelling-Systems-Mathematical-Computational/dp/1584886676
書中用的軟體是作者研發的 DBSolve。有興趣的朋友,可以玩玩看。
Jun 7, 2011
BRENDA 酵素資料庫
BRENDA 是一個收集酵素各種性質的資料庫
http://www.brenda-enzymes.org/
收集了包含結構,生化反應的一些性質,和反應的模型。
可參考
BRENDA, the enzyme information system in 2011.
Nucleic Acids Res. 2011 Jan;39(Database issue):D670-6.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21062828
http://www.brenda-enzymes.org/
收集了包含結構,生化反應的一些性質,和反應的模型。
可參考
BRENDA, the enzyme information system in 2011.
Nucleic Acids Res. 2011 Jan;39(Database issue):D670-6.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21062828
Mar 27, 2011
Genomic Medicine — An Updated Primer
New England Journal of Medicine 上的一篇 review 文章,
簡介 Genomic Medicine 的現況。
其中包含一個 Interactive Graphics,用漫畫呈現傳統定序法和新的定序法。
值得一看。
http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMra0907175
簡介 Genomic Medicine 的現況。
其中包含一個 Interactive Graphics,用漫畫呈現傳統定序法和新的定序法。
值得一看。
http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMra0907175
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